Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRA1P14867 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms