Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3O95983 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MBD3O95983 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3O95983 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3O95983 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3O95983 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms