Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TIPRLO75663 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms