Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX5O60225 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX5O60225 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX5O60225 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX5O60225 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX5O60225 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX5O60225 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX5O60225 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX5O60225 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX5O60225 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX5O60225 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms