Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 CD28-201ENST00000324106 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ABHD18-201ENST00000388795 5450 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 PSD3-203ENST00000428502 6330 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MAGOHB-201ENST00000320756 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 NOL8-229ENST00000545558 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SUPT7L-205ENST00000464789 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 NUPR1-202ENST00000395641 550 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 LINCMD1-201ENST00000418518 462 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MASP1-202ENST00000296280 4015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 PIWIL3-204ENST00000533313 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 DIS3L-201ENST00000319194 3763 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ESRP1-203ENST00000433389 3770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MAPK10-312ENST00000641391 2488 ntAPPRIS P2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MAPK10-378ENST00000642009 2463 ntAPPRIS P2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 NCAM1-228ENST00000621128 4698 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AL109809.3-201ENST00000456875 246 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC119424.1-201ENST00000472513 350 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MRPL40P1-201ENST00000542687 604 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 LRRC37A-202ENST00000393465 4997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ITPRIPL1-201ENST00000361124 4295 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ZNF322-202ENST00000456172 4718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 TTC26-202ENST00000430935 4198 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ARHGEF9-201ENST00000253401 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 CDH18-203ENST00000502796 2386 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MMGT1-201ENST00000305963 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNU1-28P-201ENST00000383861 164 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNU1-27P-201ENST00000383869 164 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNU1-1-201ENST00000383925 164 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNVU1-18-201ENST00000384010 164 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNU1-2-201ENST00000384278 164 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNU1-4-201ENST00000384659 164 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNU1-3-201ENST00000384782 164 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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