Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM200B-223ENST00000622362 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC233701.1-201ENST00000571452 4204 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ANAPC5-218ENST00000541887 2400 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC11A2-212ENST00000547688 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO6-207ENST00000615563 4026 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CLIP1-203ENST00000361654 5568 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 C17orf102-201ENST00000623254 3997 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DDR1-240ENST00000454612 3942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC170-201ENST00000239374 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 STRADA-203ENST00000375840 2209 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GAA-201ENST00000302262 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PAXBP1-AS1-201ENST00000440052 3523 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02504-201ENST00000512241 4949 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1S-201ENST00000362061 6166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NRP1-206ENST00000374867 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1841-203ENST00000402291 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AMPD2-205ENST00000393688 3217 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 C5orf66-205ENST00000555438 3246 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF185-210ENST00000454925 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FLJ31356-202ENST00000445878 3001 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FNBP1-204ENST00000446176 5393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNAB2-203ENST00000352527 4165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CR769775.4-201ENST00000638516 4139 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TEP1-209ENST00000556935 7643 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SPIN3-223ENST00000639525 3958 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000894.2-201ENST00000581719 3902 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MOV10L1-210ENST00000545383 3889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PBRM1-205ENST00000409057 4980 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CNGA3-203ENST00000393504 3841 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ST6GALNAC5-202ENST00000477717 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP1A1-211ENST00000537345 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 C2CD2-201ENST00000329623 5844 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGC4-201ENST00000306593 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 L3MBTL4-201ENST00000317931 3560 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRP-203ENST00000518525 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 POM121-204ENST00000446813 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 E2F8-202ENST00000527884 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ENDOU-202ENST00000422538 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 HERC2P3-208ENST00000430598 4279 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CENPO-206ENST00000473706 4272 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM90A8P-201ENST00000528334 1395 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 STRADA-202ENST00000336174 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 HADHAP2-201ENST00000540341 2285 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 BACH2-202ENST00000343122 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR36-206ENST00000612402 6592 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 COPA-201ENST00000241704 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 OCLN-201ENST00000355237 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CHAT-202ENST00000339797 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5S12-201ENST00000362400 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5S11-201ENST00000362464 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5S3-201ENST00000362467 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5S1-201ENST00000362482 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5S5-201ENST00000362526 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5S10-201ENST00000363040 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5S8-201ENST00000363473 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5S17-201ENST00000363500 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5S4-201ENST00000363511 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5S6-201ENST00000363754 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.5 ms