Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRPC4Q9UBN4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms