Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms