Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASS4Q9NQ75 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms