Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POP1Q99575 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POP1Q99575 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POP1Q99575 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POP1Q99575 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POP1Q99575 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POP1Q99575 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POP1Q99575 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POP1Q99575 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POP1Q99575 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POP1Q99575 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POP1Q99575 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POP1Q99575 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POP1Q99575 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POP1Q99575 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POP1Q99575 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POP1Q99575 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POP1Q99575 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POP1Q99575 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POP1Q99575 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POP1Q99575 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POP1Q99575 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POP1Q99575 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms