Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms