Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VCPIP1Q96JH7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms