Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF2Q96GP6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF2Q96GP6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms