Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC35A4Q96G79 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms