Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEIL1Q96FI4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms