Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms