Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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RABGGTAQ92696 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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RABGGTAQ92696 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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RABGGTAQ92696 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABGGTAQ92696 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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RABGGTAQ92696 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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RABGGTAQ92696 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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RABGGTAQ92696 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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RABGGTAQ92696 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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RABGGTAQ92696 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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