Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG2Q8N3U4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms