Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TREML4Q6UXN2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms