Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD1Q6UWL2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms