Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms