Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 CLPTM1L-215ENST00000515719 382 ntTSL 214.13□□□□□ -0.152e-12■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.243e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 CTPS1-204ENST00000463423 457 ntTSL 55.13□□□□□ -1.598e-7■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 PITPNA-207ENST00000575288 1264 ntTSL 223.29■■□□□ 1.322e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 TAL1-203ENST00000459729 1796 ntTSL 1 (best)18.91■□□□□ 0.622e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 EWSR1-205ENST00000360091 1289 ntTSL 516.62■□□□□ 0.251e-13■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 EWSR1-218ENST00000483629 1818 ntTSL 514.4□□□□□ -0.11e-13■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 EWSR1-215ENST00000469669 2630 ntTSL 212.22□□□□□ -0.451e-13■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 ACOT9-207ENST00000492081 683 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.912e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.942e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 HERC1-210ENST00000560897 539 ntTSL 58.91□□□□□ -0.982e-9■■■■■ 35.3
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PRPF8Q6P2Q9 PI4KA-208ENST00000475414 400 ntTSL 56.6□□□□□ -1.352e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 NASP-214ENST00000527932 650 ntTSL 35.88□□□□□ -1.478e-19■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 NASP-223ENST00000534450 632 ntTSL 25.87□□□□□ -1.472e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 PITPNA-206ENST00000574991 627 ntTSL 34.77□□□□□ -1.652e-9■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 CACNA2D4-225ENST00000589502 680 ntTSL 311.92□□□□□ -0.58e-7■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 SURF4-201ENST00000371982 553 ntTSL 312.99□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 ITPA-205ENST00000460676 488 ntTSL 38.28□□□□□ -1.085e-8■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.64e-8■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 SRP54-AS1-202ENST00000555015 561 ntTSL 310.9□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 SRP54-AS1-205ENST00000636540 565 ntBASIC9.5□□□□□ -0.894e-8■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 SRP54-AS1-201ENST00000554945 600 ntTSL 38.18□□□□□ -1.14e-8■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.124e-8■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.97e-7■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 PHF20L1-202ENST00000315808 2226 ntTSL 1 (best)15.23■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.257e-7■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 PHF20L1-208ENST00000395383 3229 ntTSL 512.87□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 35.3
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PRPF8Q6P2Q9 PHF20L1-206ENST00000395376 2236 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.937e-7■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 PHF20L1-215ENST00000486199 1633 ntTSL 23.49□□□□□ -1.857e-7■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.867e-7■■■■■ 35.3
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PRPF8Q6P2Q9 ATL2-211ENST00000456736 578 ntTSL 314.7□□□□□ -0.061e-14■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.036e-7■■■■■ 35.3
PRPF8Q6P2Q9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 35.2
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PRPF8Q6P2Q9 COX6C-203ENST00000518171 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.271e-8■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.291e-8■■■■■ 35.2
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PRPF8Q6P2Q9 COX6C-207ENST00000522934 562 ntTSL 43.52□□□□□ -1.851e-8■■■■■ 35.2
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PRPF8Q6P2Q9 SLC38A7-206ENST00000564100 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.155e-7■■■■■ 35.2
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PRPF8Q6P2Q9 LYPLA1-210ENST00000521352 580 ntTSL 516.39■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 LYPLA1-205ENST00000519272 765 ntTSL 37.57□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 PCM1-209ENST00000518930 575 ntTSL 320.13■□□□□ 0.818e-7■■■■■ 35.2
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PRPF8Q6P2Q9 CLTC-205ENST00000472651 665 ntTSL 24.28□□□□□ -1.724e-9■■■■■ 35.2
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PRPF8Q6P2Q9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.075e-8■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.725e-8■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 ARMC8-208ENST00000466762 3906 ntTSL 23.74□□□□□ -1.812e-11■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 TRPT1-214ENST00000545812 681 ntTSL 316.73■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 TRPT1-207ENST00000539436 1726 ntTSL 215.33■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 TRPT1-206ENST00000537907 602 ntTSL 314.76□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 TRPT1-208ENST00000539595 1809 ntTSL 513.93□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 TRPT1-205ENST00000536234 1748 ntTSL 312.78□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 TRPT1-213ENST00000544286 527 ntTSL 29.71□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 TRPT1-215ENST00000546089 684 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 TRPT1-211ENST00000541928 495 ntTSL 37.87□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 TRPT1-204ENST00000536158 544 ntTSL 35.84□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.683e-6■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 02e-7■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 JMJD7-PLA2G4B-203ENST00000476036 577 ntTSL 513.81□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 TCP1-214ENST00000543532 561 ntTSL 420.73■□□□□ 0.913e-9■■■■■ 35.2
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PRPF8Q6P2Q9 PPME1-202ENST00000398427 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 35.2
PRPF8Q6P2Q9 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 35.2
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