Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms