Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GFI1BQ5VTD9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms