Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms