Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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