Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms