Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Q1T7F1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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