Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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