Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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BRD3Q15059 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
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BRD3Q15059 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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BRD3Q15059 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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BRD3Q15059 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
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BRD3Q15059 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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BRD3Q15059 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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BRD3Q15059 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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BRD3Q15059 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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BRD3Q15059 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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BRD3Q15059 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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BRD3Q15059 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRD3Q15059 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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