Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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