Protein–RNA interactions for Protein: Q14694

USP10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10Q14694 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
USP10Q14694 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP10Q14694 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP10Q14694 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP10Q14694 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms