Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
BECN1Q14457 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BECN1Q14457 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
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