Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAE1Q13564 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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