Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TRAF3Q13114 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TRAF3Q13114 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TRAF3Q13114 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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TRAF3Q13114 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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TRAF3Q13114 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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