Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMARCB1Q12824 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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