Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IFFO1Q0D2I5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms