Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms