Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms