Protein–RNA interactions for Protein: P58546

MTPN, Myotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTPNP58546 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTPNP58546 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTPNP58546 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTPNP58546 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTPNP58546 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTPNP58546 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTPNP58546 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTPNP58546 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTPNP58546 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTPNP58546 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTPNP58546 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MTPNP58546 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MTPNP58546 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MTPNP58546 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
MTPNP58546 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTPNP58546 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTPNP58546 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTPNP58546 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTPNP58546 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTPNP58546 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms