Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ARFIP2P53365 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms