Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LUMP51884 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LUMP51884 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LUMP51884 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms