Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BMI1P35226 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BMI1P35226 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BMI1P35226 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BMI1P35226 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BMI1P35226 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BMI1P35226 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BMI1P35226 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BMI1P35226 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BMI1P35226 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BMI1P35226 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BMI1P35226 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BMI1P35226 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BMI1P35226 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BMI1P35226 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BMI1P35226 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BMI1P35226 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BMI1P35226 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BMI1P35226 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BMI1P35226 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BMI1P35226 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BMI1P35226 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BMI1P35226 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BMI1P35226 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BMI1P35226 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BMI1P35226 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BMI1P35226 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms