Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB3P28472 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB3P28472 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB3P28472 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB3P28472 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB3P28472 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB3P28472 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB3P28472 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB3P28472 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB3P28472 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB3P28472 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB3P28472 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB3P28472 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB3P28472 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB3P28472 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB3P28472 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB3P28472 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms