Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX2P28328 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX2P28328 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX2P28328 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX2P28328 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX2P28328 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX2P28328 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX2P28328 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX2P28328 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms