Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms