Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPD1P17405 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPD1P17405 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms