Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB3P16520 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB3P16520 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB3P16520 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms