Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2BP0DI82 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms