Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms